概述：
免疫学是生物医学的一个主要大分支，其探讨的是在各器官中所产生的免疫反应。主要讨论在健康或是生病时免疫系统所扮演的生理功能角色；一些免疫系统病变所产生的疾病（例如自体免疫反应、过敏反应、免疫功能失调）；在体内（in vivo）或是体外（in vitro）免疫系统构成分子的物理、化学、生理性质。
免疫系统的组织学
主要的免疫系统包括胸腺、脾脏、骨髓、淋巴管、淋巴节和二次淋巴组织（如扁桃腺或是增殖腺）、皮肤。在免疫系统在组织学的检查上，主要的器官、胸腺以及脾脏只能在死后解剖上得以了解，但是类似淋巴结或是二次淋巴组织可以在存活的状态下经由外科手术来得以认识。免疫系统上许多组成分子多半以细胞的形式在身体的各器官、组织中运行。
古典免疫学
古人发现一个人如果得了某种传染病，可以长期或终身不再得这种病，有的即使再得病，也是比较轻微而不致死亡。人们从中得到启发，懂得“以毒攻毒”的原理，即是在未病之前，先服用或接种这有毒的致病物质，使人体对这些疾病产生特殊的抵抗力，这种思想包含有近代医学的免疫萌芽了。
在“以毒攻毒”思想指导下，中国也在寻找预防天花的方法。明代郭子章《博集稀痘方》（1557年）、李时珍《本草纲目》，记载用（白）水牛虱和粉作饼或烧灰存性和粥饭服下，以预防天花的方法。虽然这种方法尚未得到实际效果，但是，它表明古人在“以毒攻毒”思想下，正在寻找防治天花的方法。经过长期的摸索与多方面的临床实验，终于找到了行之有效的牛痘接种法。
临床免疫学
临床免疫学主要研究免疫系统造成的疾病，或是其他医疗导致的免疫系统产生病变。大多数的发生的免疫疾病主要可以分成两大项。一是免疫系统防卫上的缺陷，在这部分发生缺损，将无法产生适应免疫反应上的疾病（如慢性肉芽肿 chronic granulomatous disease）和自体免疫反应（autoimmunity），也就是免疫系统攻击自己的抗原（比方说红斑性狼疮systemic lupus erythematosus、关节炎rheumatoid arthritis或重症性无力症 myasthenia gravis等疾病）。另一个则是因为其他免疫系统发生病变，包括引起各式的过敏反应，例如对于无害分子化合物的产生反应（如气喘asthma、过敏allergies）或是反应过渡激烈。
艾滋病即是著名的免疫系统疾病，其由HIV病毒所引起。目前了解，艾滋病导因于因HIV病毒感染后，导致含有CD4+（CD4阳性）受体的淋巴细胞（辅助T细胞)及巨噬细胞和部分种类的B细胞受其感染、破坏，最终使得免疫系统崩溃。
临床免疫学也研究许多方法，来避免许多器官组织移植上所引起的过度激烈免疫反应。如：避免同种移植allograft或是异种移植xenograft后被免疫系统所排斥、破坏。
免疫疗法
利用免疫系统成分来治疗疾病，也就是所谓的免疫疗法。在癌症的治疗上，常伴随着化疗chemotherapy或是放射线治疗radiotherapy。然而，通常免疫疗法被用来作为像是艾滋病患，或是其他免疫缺陷疾病，或是自体免疫病症病人之免疫抑制。
诊断免疫学
抗体和抗原的结合所形成的特殊键结，为诊断科学上的相当有利的工具。而在抗体上可以标记放射线物质、可以呈色的酵素、以及萤光物质等。便可以当作探针来标记抗原所在。
常用的技术像是免疫墨点法，ELISA，或是于切片上做免疫组织染色等。而现今，一些抗体常被制作出快速准确且简单的检验试剂，用以检测疾病，或是特殊物质等。演化免疫学
以研究现存生物物种之免疫系统为主，使我们可以利用免疫系统上的差异来了解物种的演化以及物种间免疫系统上的差异。以演化角度来看，免疫系统的复杂度，可以由简单的微生物的胞饮作用，或是昆虫体内的抗菌蛋白质，到脊椎动物的淋巴系统。另外像是昆虫或是其他节肢动物并没有适应免疫系统，仅有先天免疫系统。附带一提，适应免疫系统也只有脊椎动物才具有。
心理神经免疫学
心理神经免疫学（psychoneuroimmunology），是涉及心理学、神经系统和免疫系统的研究结果的一门学科。
通过对神经递质（化学信使，例如：多巴胺、去甲肾上腺素）的研究表明：在大脑和免疫系统活动最广泛的神经递质，在调节情绪的神经区域分布也最为密集。由此，可以推断出情绪通过一条直接的物理通道影响免疫系统。
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